В апреле 1991 года состоялся Учредительный круг Якутского казачьего полка, ознаменовавший начало возрождения Якутского казачества и давший толчок активизации участия якутских казаков в общественной и политической жизни Республики Саха (Якутия).

С 1991 по 1993 год первым атаманом возрожденного Якутского казачьего полка был Павел Филиппович Задорожный, в настоящее время он является I-м заместителем Верховного атамана Союза казаков России.

Атаманами полка были Борис Николаевич Вакуленко (1994 - 1995), Алексей Владимирович Коваленко (октябрь 1995 - январь 1998).

С 1 марта 1998 года по настоящее время атаманом является Александр Дмитриевич Козырь.

За эти годы возрождено казачество в Якутске, Вилюйске, Сангаре, Мирном, Удачном, Ленске, Пеледуе, Олекминске, Нерюнгри, Алдане, Нижнем-Бестяхе, Верхнем-Бестяхе, Усть-Куйге, Чокурдахе и многих других поселках.

Современные казаки возродили воинскую славу своих предков, защищая конституционный порядок и единство России. Якутский казачий полк гордится именами казаков, погибших за мир и справедливость в России: снайпера из Вилюйска Ивана Винокурова, российского офицера Виктора Мыльникова, бойца ОМОНА Станислава Голомарева.

В феврале 2001 г. состоялись мероприятия, посвященные празднованию 300-летию Якутского казачьего полка.

К этому юбилейному мероприятию был подписан Указ Президента РС(Я) "О государственной поддержке подразделений Якутского казачьего полка", издана книга Алексея Черткова "История Якутского казачества", подготовлена передача "Казачьему роду нет переводу".

При казачьем полке действуют фольклорные коллективы: казачий ансамбль "Горлинка" (руководитель Людмила Латынцева), табагинский казачий ансамбль "Казачок" (Алена Третьякова), мохсоголохский детский казачий хор "Казачата" (Ирина Стрекаловская), удачнинский казачий хор (Инна Сметанина), а также синский народный фольклорный ансамбль "Реченька".

В летнее время с 1999 года по 2000 год на базе бывшего пионерского лагеря работал детско-юношеский военно-патриотический центр "Удалец".

Атаман Якутского казачьего полка А.Д.Козырь и начальник штаба Ф.И.Бондарев регулярно принимают участие в работе Совета Атаманов Союза казаков России, а также участвуют во всех общественно-политических мероприятиях, проводимых в республике.